Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHPRHQ149N8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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