Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN1Q14457 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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