Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTTNQ14247 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTTNQ14247 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms