Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGB1Q14028 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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