Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL4BQ13620 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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