Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CUL1Q13616 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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