Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2Q13563 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
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