Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC1Q13547 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC1Q13547 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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