Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRQ13535 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRQ13535 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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