Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDAP1Q13442 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDAP1Q13442 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms