Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR5A1Q13285 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms