Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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