Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR1H3Q13133 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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NR1H3Q13133 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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