Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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TRAF3Q13114 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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TRAF3Q13114 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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TRAF3Q13114 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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TRAF3Q13114 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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TRAF3Q13114 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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TRAF3Q13114 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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TRAF3Q13114 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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