Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDC16Q13042 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDC16Q13042 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms