Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms