Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXF1Q12946 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXF1Q12946 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms