Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TP53BP1Q12888 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TP53BP1Q12888 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms