Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CNTN1Q12860 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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