Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD300CQ08708 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms