Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL1Q08397 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms