Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms