Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCL9Q07325 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms