Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC9Q06265 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms