Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE3AQ05086 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms