Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNC1Q01954 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms