Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MC1RQ01726 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MC1RQ01726 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms