Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MYBPC1Q00872 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms