Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK6Q00534 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms