Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK3Q00526 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK3Q00526 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms