Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC5Q00444 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms