Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAE1P78406 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAE1P78406 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAE1P78406 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAE1P78406 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAE1P78406 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAE1P78406 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAE1P78406 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAE1P78406 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAE1P78406 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAE1P78406 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAE1P78406 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms