Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBA52P62987 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBA52P62987 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBA52P62987 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBA52P62987 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBA52P62987 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBA52P62987 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBA52P62987 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBA52P62987 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBA52P62987 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBA52P62987 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBA52P62987 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBA52P62987 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBA52P62987 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBA52P62987 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBA52P62987 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBA52P62987 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBA52P62987 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBA52P62987 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms