Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms