Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPCS3P61009 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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