Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms