Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBP60709 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBP60709 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms