Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CABP4P57796 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CABP4P57796 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CABP4P57796 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CABP4P57796 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CABP4P57796 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms