Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP7P55210 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP7P55210 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms