Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF8P55075 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FGF8P55075 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGF8P55075 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms