Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD23AP54725 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms