Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMTNP53814 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMTNP53814 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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