Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCR4P51679 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCR4P51679 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCR4P51679 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCR4P51679 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCR4P51679 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms