Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK8P49336 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK8P49336 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK8P49336 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK8P49336 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK8P49336 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK8P49336 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK8P49336 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK8P49336 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDK8P49336 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK8P49336 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK8P49336 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK8P49336 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK8P49336 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms