Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNI2P48788 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNNI2P48788 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms