Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA2P47869 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABRA2P47869 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms