Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRXP46100 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRXP46100 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRXP46100 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRXP46100 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRXP46100 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRXP46100 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRXP46100 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRXP46100 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRXP46100 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRXP46100 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRXP46100 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRXP46100 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRXP46100 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRXP46100 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms