Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK1P39086 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms