Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZEB1P37275 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms