Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms